Le conseil scientifique assiste le conseil d'administration et le directeur général de l’IAC. Il est consulté sur les grandes orientations, la cohérence de la politique scientifique et l'organisation scientifique de l'Institut. Il donne son avis sur les programmes de recherche et d'études, et il participe à l'élaboration du projet de programmation quinquennale. Il permet ainsi de définir des priorités de recherche claires et la stratégie scientifique de l’établissement.
Le conseil scientifique est composé de 12 membres : six personnalités scientifiques françaises et/ou étrangères extérieures à l'Institut et nommées, et six membres scientifiques élus parmi et par les personnels de l’IAC. Le mandat des membres est de cinq ans, renouvelable.
Membres du conseil scientifique
Membres nommés

Valérie Burtet Sarramégna (présidente du CS)
Chercheuse en biochimie et biologie moléculaire, Université de la Nouvelle-Calédonie

Luc Della Patrona
Chercheur en écologie aquacole, UR LEAD, Ifremer, Nouvelle-Calédonie

Myrielle Dupont-Rouzeyrol
Chercheuse responsable de l’URE Dengue et Arboviroses, Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie

Stéphane Ghiotti
Chercheur en sciences humaines et sociales / géographie, UMR Art-Dev, CNRS, Montpellie

Hervé Jourdan
Chercheur en écologie de la conservation / invasions biologiques, UMR IMBE, IRD, Nouvelle-Calédonie

Jean-Paul Laclau
Chercheur en biogéochimie des agro-écosystèmes, directeur du département Persyst, Cirad, Montpellier
Membres élus

Fabrice Brescia
Chercheur en écologie animale, équipe ARBOREAL

Julien Drouin
Ingénieur en agroécologie, équipe SOLVEG

Stéphane Lebégin
Ingénieur en agroécologie, équipe ARBOREAL

Christian Mille
Chercheur en entomologie, équipe ARBOREAL

Nadia Robert
Chercheuse en physiologie végétale, équipe SOLVEG